1.有没有推荐的期刊呀？针对网络药理学和分子对接，不需要实验验证的？

答：期刊：可通过相关网络公众号推文了解。如云生信学生物信息学公众号有一些推荐，其次网络药理学文章其中的一些对应期刊等。也可以去小木虫上问问，上面交流投稿的有很多。

2.请问GO分析怎么看有多少生物学过程，多少细胞组分，多少分子功能呀？

(资料图片)

答：数据库导出后的数据筛选P值后看有多少条BP/CC/MF。

3.这个2倍degree值的中位数怎么找，不太理解这个意思？

答：是在degree值那一列，使用median函数筛的意思。选将数据导出使用Excel在Degree值那一列用median函数筛选。不一定取2倍，取中位数基因数达到也可以。

4.用david还是metascape做富集分析更好呀？

答：Meatascape数据库更新快，覆盖面普遍，整合了GO、KEGG、Uniport和Drugbank等多个权威的数据库，使其不仅仅完成通路富集和生物过程注释，还可以作基因相关的蛋白网络分析和涉及到的药物分析，使用meatascape数据库，其可生成一个简单明了的报告，图文并茂，而且能够下载excel表，ppt和zip文件。对于DAVID数据库操作过程简单和meatascpe差不多，数据库近几年也有所更新，但DAVID的富集结果没有可视化，没有很直观的图文描述，需要自己点击基因列表分析的BP、CC查看基因详细情况。按自己需求选取各有优势。

5.string导出的图有的点不连接是什么意思，需要怎么处理？

答：不连接的点是该蛋白与其它蛋白之间没产生一定联系，一般为了美观可以删掉。

6.请问一下度中心性（Degree Centrality，DC）和接近中心性（Closeness Centrality,CC）怎么知道，在cytoscape中用cytoNCA分析可以知道靶点的中介中心性（Betweenness Centrality,BC）值，这个和上面的两个有关系吗，但是药物的这两个值又该怎么获取呢？

答：cytoNCA里都有并且可以进行相应数据分析。然后可以看一下https://mbd.baidu.com/ma/s/lOkaapGM网站介绍的内容，就可以知道它们之间的关系。

7.要做的是药物作用于疾病的相关靶点通路，那如果想要探究药物与细胞之间的靶点通路，应该怎么做？

答：查阅文献看看有无细胞的基因，有了基因分析方法与药物疾病相关靶点通路是一样的。另外补充两个查询基因在细胞、组织中表达的数据库、ENA Browser (ebi.ac.uk)、NCBI、the human protein atlas数据库。